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| Alex |
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Verfasst am: 29.11.2007, 11:59
Titel: Matlab und ImageJ
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Ist es möglich ein Plugin zu entwickeln, um z.B. Daten von ImageJ an Matlab zu übergeben?
Hat das jemand mal versucht?
Ist es möglich?
Gruß
_________________
Gruß
Alex
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Verschoben: 29.11.2007, 12:16 Uhr von Bijick
Von Programmierung nach Sonstige MATLAB Fragen |
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| elhadj |
Gast
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Verfasst am: 14.01.2008, 14:42
Titel: MIJ
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Hilft dir das hier?
-http://bigwww.epfl.ch/sage/soft/mij/-
(Link ohne Striche vorne und am Ende). Du kannst aber auch manche Daten im Zwischenspeicher kopieren (copy n paste) und per "pastespecial" oder so aähnlich in MATLAB importieren. Oder ImageJ-Tabellen mit *.xls endung speichern und dann in Matlab importieren.
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| Alex |
Themenstarter
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Verfasst am: 30.01.2008, 12:22
Titel:
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ja der link hilft mir weiter!!!
nur ich hätte gerne noch beispiele 
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Gruß
Alex
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| Alex |
Themenstarter
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Verfasst am: 21.02.2008, 11:24
Titel:
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ok funktioniert. weiß jmd wie man einen stack einlesen kann? einzelne bilder klappt...
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Gruß
Alex
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| steve |
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Verfasst am: 21.02.2008, 13:22
Titel:
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Moin,
durchsuch mal das Forum nach multiselect - wenn da nix passendes dabei ist, dann müsstest du etwas genauer schreiben, was du machen willst.
Gruß
Alex
_________________
>> I told me to.
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Matlab Cheat Sheet
goMatlab-Knigge - dran gehalten?!
Schon in den FAQ gesucht?
Ist vielleicht bei den Skripten oder den Tutorials was für dich dabei?
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| Alex |
Themenstarter
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Verfasst am: 29.02.2008, 15:35
Titel:
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ich habe z.b. einen stack von bildern in imagej, möchte den gerne nach matlab importieren und dann die images weiter zu benutzen.
ich hatte nur die idee den stack wieder in einzelne bilder zu zerlegen und dann zu importieren und nach dem arbeiten wieder zusammen zufügen.
gruß
_________________
Gruß
Alex
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| unclefish |
Forum-Anfänger
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Verfasst am: 03.06.2008, 18:09
Titel:
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Mit dem folgenden Code klappt's prima:
function [output] = loadstack (input);
[stack,direct1] = uigetfile('*.tif', 'Select The Image Stack');
cd (direct1)
info1 = imfinfo (stack);
r = max([info1.Height]);
c = max([info1.Width]);
z = length([info1.FileSize]);
for i = 1:z;
I(:,:,i) = imread(stack,i);
end
In der Funktionszeile kannst du je nach Wunsch Output und Input definieren wie du magst.
Wenn das durchläuft erscheint dein Imagestack als "I" in deinem Workspace.
Wichtig! Aus einem mir bisher nicht ersichtlichen Grund funktioniert das nur mit ".tif" Dateien. Du musst also vorher deinen Bilderstapel als TIF Datei speichern.
_________________
Gruss,
Thomas
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| Anja |
Gast
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Verfasst am: 07.01.2009, 17:01
Titel: automatsich umbenennen
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Der code von unclefish hat mir super geholfen. Nun möchte ich aber mehrere stacks laden und die Imagestacks sollen dann natürlich nicht alle I heißen, bzw. ich will nicht jeden nochmal umbennen. Gibt es eine Funktion, mit der man den stack dann wie ein Bestandteil des original tiffs nennen kann (z.B. die letzten drei Zeichen des Namens des tiff-stacks) 
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