paralles ausführen einer Funktion auf GPU - arrayfun - Mein MATLAB Forum

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paralles ausführen einer Funktion auf GPU - arrayfun

Stefan_kl

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Verfasst am: 04.09.2015, 17:47 Titel: paralles ausführen einer Funktion auf GPU - arrayfun

Hallo,
bei der Ausführung eines genetischen Optimierungsalgorithmus werden die Invidiuen einer Population auf ihre fitness überprüft. Dabei stehen m Eigenschaften von n individuen in einer n x m-Matrix (population). Die fitness wird innerhalb einer subfunktion berechnet (basisberechnungen: addition, subtraktion, fft, fftshift, conj, also auf GPU-Ebene bekannte Funktionen).

Mein Ziel ist es nun, zwecks Zeitersparnis, diese subfunktion für jedes Individum parallel auf der GPU zu berechnen.

Hier ein sehr sehr vereinfachtes Beispiel. In "pop" stehen die m Eigenschaften der n individuen.
Das Problem: Hier wird die Subfunktion elementweise und nicht zeilenweise aufgerufen. Wie schaffe ich es, dass jedes der n Individuen komplett und parallen auf der GPU berechnet wird?

Code:

function []=main(varagin)
clear all
n=10;
m=3;
pop=rand(n,m,'gpuArray'); % population, die aus n Individuen mit je m (konstant) Eigenschaften besteht

% zur Überprüfung der Fitness muss jedes einzelne Indiviuduum (1 x m) an eine Funktion (subfunktion) übergeben werden
% dies kann grundsätzlich parallel ausgeführt werden.

erg=arrayfun(@subfunktion,pop); %mein Versuch des Funktionsaufrufes

% mit pagefun kam Error: The GPU does not support the specified function handle using PAGEFUN.

function [fehler]=subfunktion(population)% funktion(i(1),i(2),i(3))
% size(population)=1 1 und nicht 1 m
% eigenschaft1=population(1) usw
% fehler=funktion(eigenschaft1,...)
end
end

Funktion ohne Link?

Benutze Matlab 2015a mit parallel computing toolbox, Win7, Geforce GTx 880m mit CUDA 7.0.

Danke für eure Hilfe und Tipps


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