Error beim Ausführen von kompilierten M-File unter Linux

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huyphys

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Verfasst am: 18.09.2009, 11:53 Titel: Error beim Ausführen von kompilierten M-File unter Linux

Hallo zusammen,

ich habe gerade mit Matlab-Compiler angefangen und wollte den Beispiel von Matlab probieren. Ich habe den M-File (magicsquare.m) mittels "mcc -m magicsquare.m" kompiliert (unter Ubuntu). Aber beim Ausführen bekomme ich den Error :

"./magicsquare: error while loading shared libraries: libmwmclmcrrt.so: cannot open shared object file: No such file or directory"

der Bibliothek "libmwmclmcrrt.so" liegt in Verzeichnis "/usr/local/matlab/bin/glnx86"

ich möchte gern fragen:
Wie kann ich Ubuntu sagen, dass er den Bibliothek in Verzeichnis "/usr/local/matlab/bin/glnx86" suchen soll?
bzw. hat jemand eine Lösung für das Problem oder weiss, wie man den Error aufheben kann?

Vielen Dank und Mit freundlichen Grüßen,

denny

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Verfasst am: 18.09.2009, 13:09 Titel:

Hallo,

wahrscheinlich muss du die Bibliothek einbeziehen,
zumindest habe ich unter Windows so gelöst.

Code:

mcc -m magicsquare.m -a /usr/local/matlab/bin/glnx86/*.so

Funktion ohne Link?

huyphys

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Verfasst am: 18.09.2009, 14:19 Titel:

Danke für die Antwort. Ich habe probiert. Es hat aber nicht funktioniert. Ich poste hier alles, was während der Kompilierung angezeigt wurde :
(mit dem Befehl : mcc -mv magicsquare.m)

Code:

%root@huy-laptop:/windows/BSP_MATLAB_LINUX# mcc -mv magicsquare.m
-----------------------------------------------------------------
Loaded cache file: /home/huy/.matlab/R2008b/mcc.cache/1.24.4.17:huy-laptop:644596010
-----------------------------------------------------------------
Locking assertion failure. Backtrace:
#0 /usr/lib/libxcb-xlib.so.0 [0xb4c867c7]
#1 /usr/lib/libxcb-xlib.so.0(xcb_xlib_unlock+0x31) [0xb4c86891]
#2 /usr/lib/libX11.so.6(_XReply+0x254) [0xb51e2494]
#3 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/xawt/libmawt.so [0xa330d8ce]
#4 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/xawt/libmawt.so [0xa32ea067]
#5 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/xawt/libmawt.so [0xa32ea318]
#6 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/xawt/libmawt.so(Java_sun_awt_X11GraphicsEnvironment_initDisplay+0x2f) [0xa32ea61f]
#7 [0xafe39ecd]
#8 [0xafe32edd]
#9 [0xafe32edd]
#10 [0xafe30249]
#11 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/client/libjvm.so [0x621c40d]
#12 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/client/libjvm.so [0x6310378]
#13 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/client/libjvm.so [0x621c2a0]
#14 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/client/libjvm.so(JVM_DoPrivileged+0x363) [0x6272153]
#15 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/libjava.so(Java_java_security_AccessController_doPrivileged__Ljava_security_PrivilegedAction_2+0x3d) [0xb1f0d96d]
#16 [0xafe39ecd]
#17 [0xafe32d77]
#18 [0xafe30249]
#19 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/client/libjvm.so [0x621c40d]
Locking assertion failure. Backtrace:
#0 /usr/lib/libxcb-xlib.so.0 [0xb4c867c7]
#1 /usr/lib/libxcb-xlib.so.0(xcb_xlib_lock+0x2e) [0xb4c8696e]
#2 /usr/lib/libX11.so.6 [0xb51e1619]
#3 /usr/lib/libX11.so.6(XGetVisualInfo+0x26) [0xb51d7666]
#4 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/xawt/libmawt.so [0xa32e9319]
#5 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/xawt/libmawt.so [0xa32e9565]
#6 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/xawt/libmawt.so [0xa32ea3c9]
#7 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/xawt/libmawt.so(Java_sun_awt_X11GraphicsEnvironment_initDisplay+0x2f) [0xa32ea61f]
#8 [0xafe39ecd]
#9 [0xafe32edd]
#10 [0xafe32edd]
#11 [0xafe30249]
#12 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/client/libjvm.so [0x621c40d]
#13 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/client/libjvm.so [0x6310378]
#14 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/client/libjvm.so [0x621c2a0]
#15 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/client/libjvm.so(JVM_DoPrivileged+0x363) [0x6272153]
#16 /usr/local/matlab/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/libjava.so(Java_java_security_AccessController_doPrivileged__Ljava_security_PrivilegedAction_2+0x3d) [0xb1f0d96d]
#17 [0xafe39ecd]
#18 [0xafe32d77]
#19 [0xafe30249]
Compiler version: 4.9 (R2008b)
Processing /usr/local/matlab/toolbox/matlab/mcc.enc
Warning: Name is nonexistent or not a directory:
/usr/local/matlab/toolbox/compiler/patch.
Warning: Name is nonexistent or not a directory:
/usr/local/matlab/toolbox/compiler/patch.
Processing include files...
2 item(s) added.
Processing directories installed with MCR...
The file mccExcludedFiles.log contains a list of functions excluded from the CTF archive.
0 item(s) added.
Generating MATLAB path for the compiled application...
Created 38 path items.
Begin validation of MEX files: Fri Sep 18 14:13:00 2009
End validation of MEX files: Fri Sep 18 14:13:00 2009
Warning: Name is nonexistent or not a directory:
/usr/local/matlab/toolbox/compiler/patch.
Deleting 0 temporary MEX authorization files.
Parsing file "/windows/BSP_MATLAB_LINUX/magicsquare.m"
(Referenced from: "Compiler Command Line").
Parsing file "/usr/local/matlab/toolbox/compiler/deploy/deployprint.m"
(Referenced from: "Compiler Command Line").
Parsing file "/usr/local/matlab/toolbox/compiler/deploy/printdlg.m"
(Referenced from: "Compiler Command Line").
Generating file "magicsquare_main.c".
Generating file "/windows/BSP_MATLAB_LINUX/run_magicsquare.sh".
Generating file "/windows/BSP_MATLAB_LINUX/readme.txt".
Generating file "magicsquare_mcc_component_data.c".
Executing command: mbuild -O -v -output "magicsquare" "magicsquare_main.c" "magicsquare_mcc_component_data.c" -link exe
Warning: You are using gcc version "4.3.2-1ubuntu12)". The earliest gcc version supported
with mbuild is "4.0.0". The latest version tested for use with mbuild is "4.2.0".
To download a different version of gcc, visit http://gcc.gnu.org
----------------------------------------------------------------
-> mbuildopts.sh sourced from directory (DIR = $HOME/.matlab/$REL_VERSION)
FILE = /home/huy/.matlab/R2008b/mbuildopts.sh
----------------------------------------------------------------
-> TMW_ROOT = /usr/local/matlab
-> CC = gcc
-> CC flags:
CFLAGS = -ansi -D_GNU_SOURCE -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -I/usr/local/matlab/extern/include -DUNIX -DX11 -pthread
CDEBUGFLAGS = -g
COPTIMFLAGS = -O -DNDEBUG
CLIBS = -Wl,-rpath-link,/usr/local/matlab/bin/glnx86 -L/usr/local/matlab/bin/glnx86 -lmwmclmcrrt -lm
arguments =
-> LD = gcc
-> Link flags:
LDFLAGS = -pthread
LDDEBUGFLAGS = -g
LDOPTIMFLAGS = -O
arguments =
----------------------------------------------------------------

-> gcc -c -ansi -D_GNU_SOURCE -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -I/usr/local/matlab/extern/include -DUNIX -DX11 -pthread -O -DNDEBUG "magicsquare_main.c"

-> gcc -c -ansi -D_GNU_SOURCE -D_FILE_OFFSET_BITS=64 -I/usr/local/matlab/extern/include -DUNIX -DX11 -pthread -O -DNDEBUG "magicsquare_mcc_component_data.c"

-> gcc -O -pthread -o magicsquare magicsquare_main.o magicsquare_mcc_component_data.o -Wl,-rpath-link,/usr/local/matlab/bin/glnx86 -L/usr/local/matlab/bin/glnx86 -lmwmclmcrrt -lm

Funktion ohne Link?

hat vielleicht jemand Ahnung, wo das Problem liegen könnte?

Vielen Dank

denny

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Verfasst am: 18.09.2009, 14:30 Titel:

Hallo,

da wird eigentlich noch ReadMe mitgeneriert, hast du es bereits durchgelesen?

Das steht bei mir in ReadMe folgendes (generiert mit Matlab R2007b)

Zitat:

On UNIX systems:

* Add the MCR directory to the environment variable by issuing
the following commands:

Linux
setenv LD_LIBRARY_PATH
<mcr_root>/v77/runtime/glnx86:
<mcr_root>/v77/sys/os/glnx86:
<mcr_root>/v77/sys/java/jre/glnx86/jre1.6.0/lib/i386/native_threads:
<mcr_root>/v77/sys/java/jre/glnx86/jre1.6.0/lib/i386/server:
<mcr_root>/v77/sys/java/jre/glnx86/jre1.6.0/lib/i386
setenv XAPPLRESDIR <mcr_root>/v77/X11/app-defaults

huyphys

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Verfasst am: 19.09.2009, 00:24 Titel:

Danke für die Hilfe
ich habe das Problem gelöst.
Übrigens mit dem File "run_magicsquare.sh"
und dem command "./run_magicsquare.sh <matlab_root>"


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