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Importieren von ROIs aus LSM-files (Zeiss-Format)

 

fulder
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Beiträge: 2
Anmeldedatum: 19.01.10
Wohnort: ---
Version: ---
     Beitrag Verfasst am: 19.01.2010, 19:05     Titel: Importieren von ROIs aus LSM-files (Zeiss-Format)
  Antworten mit Zitat      
Hallo,

ich suche nach einer Moeglichkeit, ROIs aus LSM-files auszulesen. Soweit ich das sehe bietet tiffread27 diese Moeglichkeit nicht.

gruss fulder
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denny
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Beiträge: 3.853
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Wohnort: Ulm
Version: R2012b
     Beitrag Verfasst am: 19.01.2010, 19:28     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Hallo,

kannst du bitte erklären, was du unter ROIs meinst? Nur bestimmten Bereich im Bild auszulesen?
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fulder
Themenstarter

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Beiträge: 2
Anmeldedatum: 19.01.10
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     Beitrag Verfasst am: 20.01.2010, 11:21     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Verschiedene Funktionen in der Zeiss Software wie FRET (aceptor photo bleaching) und FRAP werden in der Regel nur auf bestimmte Bereiche des Bildausschnitts angewand, hierzu definiert man ein ROI (Region of Interest). In diesem ROI wird fuer eine bestimmte Zeitdauer zu einem bestimmten Zeitpunkt ein Teil der Farbstoffe im Bild geblichen.

Diese Informationen werden im LSM Format gespeichert, allerdings lassen sich diese Informationen nicht mit dem tiffread27 auslesen. Ich bin jetzt auf der Suche nach einer Moeglichkeit diese Infos in Matlab einzulesen.

gruss fulder
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