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Performance von Blob-Messungen und Schwellwertanwendung
 

leon_81

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     Beitrag Verfasst am: 15.11.2011, 09:05     Titel: Performance von Blob-Messungen und Schwellwertanwendung
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Hallo Zusammen,

ich habe eine Frage zu den folgenden Code-Auszügen: wie kann ich die Berechnungen schneller machen? Bei größeren Bildern geht der Algorithmus rasch in die Knie was die Rechenzeit betrifft...

Blob-Messungen auf einem gelabelten Bild:
Code:

c = 1;
o = 1;
 
while c <= n
       
    [xx yy] = find(labeled_image(:,:)==c);
   
    while o <= length(xx)
        blob_image(xx(o),yy(o)) = length(xx);
        o = o+1;
    end;
    o = 1;
    c = c+1;
       
end;
 


--------------------------
Schwellwertanwendung:
Code:

  [xx yy] = find(image_g >= 0);
    image_y = zeros(a,b);
   
    c = 1;
    while c <= length(xx)
        if image_g(xx(c),yy(c)) <= k
            image_y(xx(c),yy(c)) = 1;
        else
            image_y(xx(c),yy(c)) = 0;
        end;
     c = c+1;
    end;
 


--------------------------

Vorab vielen herzlichen Dank für Eure Vorschläge!


Jan S
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     Beitrag Verfasst am: 15.11.2011, 13:49     Titel: Re: Performance von Blob-Messungen und Schwellwertanwendung
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Hallo leon_81,

Code:
for c = 1:n      
    index = (labeled_image == c);  % labeled_image(:,:) raubt Zeit
    blob_image(index) = sum(index(:));
end


Code:
   image_y = zeros(a,b);
    image_y(image_g >= 0 & image_g <= k) = 1;

Wenn ich es richtig vertsanden habe, sollte dies bereits reichen. Möglicherweise sind kleine Änderungen nötig.

Gruß, Jan
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leon_81

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     Beitrag Verfasst am: 15.11.2011, 14:19     Titel:
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Hallo Jan,

erstmal vielen Dank für Deine Rückmeldung!

Dein Vorschlag für das Thresholding liefert jedoch einen Zeilenvektor zurück - ich benötige jedoch ein dimensionsidentisches Bild als Ausgabe, in dem die entsprechenden Pixel auf 0 oder 1 gesetzt sind.

Der Blob-Algorithmus ist leider noch nicht schneller geworden. Kann man nicht irgendwie über die bwlabel-Funktion und deren Hintertürchen auf die einzelnen Label zugreifen und die entsprechenden Pixelwerte verändern?

Vorab vielen Dank für Deine bzw. Eure weiteren Rückmeldungen!
 
Jan S
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     Beitrag Verfasst am: 15.11.2011, 23:45     Titel:
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Hallo leon_81,

Nein, mein Thresholding liefert eine Matrix der Größe [a, b] zurück. Die Initialisierung per "zeros(a,b)" stellt dies sicher.

Mit einem 1024x768 Bild und 8 verschiedenen Labels komme ich mit meiner Methode auf 0.07 Sekunden. Mit Deiner Methode waren es 2.7 Sekunden.

Bitte poste also nochmal eine exakte Kopie des von Dir verwendeten Codes und sinnvolle Testdaten - per RAND erzeugte sind oft nützlich für solche Tests.

Gruß, Jan
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leon_81

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     Beitrag Verfasst am: 16.11.2011, 09:24     Titel:
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Hallo Jan,

vielen Dank für Deine erneute Antwort.
Die Initialisierung mit zeros hatte ich übersehen.

Wie wird in Matlab die Übergabe von großen Matrizen (z.B. 10000x10000) an Funktionen gehandhabt? in einer Schleife kann das evtl zum (Geschwindigkeits)Problem werden (z.B. Übergabe an Funktion, Neuberechnung und erneute Übergabe der Neuberechnung).

Viele Grüße!
 
Jan S
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     Beitrag Verfasst am: 16.11.2011, 12:37     Titel:
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Hallo leon_81,

Es ist immer sehr wichtig, alle Zeilen eines Vorschlages zu berücksichtigen. Ich denke mir schon manchmal etwas dabei, wenn ich eine Antwort poste.

Funktioniert die Blob-Messung nun schneller? Ich meine die Beschleunigung von 2.7 auf 0.07 Sekunden sollte irgendwie bemerkbar sein.

Zitat:
Wie wird in Matlab die Übergabe von großen Matrizen (z.B. 10000x10000) an Funktionen gehandhabt? in einer Schleife kann das evtl zum (Geschwindigkeits)Problem werden (z.B. Übergabe an Funktion, Neuberechnung und erneute Übergabe der Neuberechnung).

Wieso vermutest Du, dass dies in Schleifen zu Problemen führt?
Matlab gibt Arrays mit mehr als einem Element per Copy-on-Write-Policy an Unterfunktionen. Das heißt, es wird zunächst eine "Shared-Data-Copy" weitergeben, die einen Pointer auf die Orginal-Daten enthält. Erst wenn in diese Daten geschrieben wird, wird der Speicherinhalt dupliziert.
Solange man also nur lesend zugreift, ist Matlab sehr schnell. Wenn man nur eine Zahl ändern möchte, wäre dafür ein Unterprogramm ungeeignet. Besser wäre es, im Unterprogramm nur den Index und den neuen Wert zu ermitteln und ihn an das Hauptprogramm weiterzugeben, dass dann in das Orginal-Array schreibt.

Gruß, Jan
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leon_81

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     Beitrag Verfasst am: 16.11.2011, 14:58     Titel:
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Hallo Jan,

alles klar, werde diesen Ratschlag befolgen.
Vielen Dank für's erste und Grüße
 
Jan S
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     Beitrag Verfasst am: 16.11.2011, 18:18     Titel:
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Hallo leon_81,

Ich hatte ein paar Fragen gestellt. Die Antworten könnten für andere Teilnehmer des Forums nützlich sein.
Der Ttitel Deiner Frage war: "Performance von Blob-Messungen und Schwellwertanwendung"
Ist das Problem gelöst? Bist Du mit der Performance nun zufrieden?

Gruß, Jan
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leon81

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     Beitrag Verfasst am: 24.11.2011, 10:29     Titel:
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Hallo Jan,

sorry wg der verspäteten Rückmeldung.
Ja, Deine Vorschläge haben mir weitergeholfen.

Nochmals vielen Dank und Grüße
 
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