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Baseline Offset bei lsqlin berücksichtigen |
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| spiele-joe |
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Verfasst am: 14.04.2016, 17:27
Titel: Baseline Offset bei lsqlin berücksichtigen
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Hallo,
ich habe ein Optimisierungsproblem mittels non-negative least-squares zu lösen. Dazu habe ich ein linearisiertes Gleichungssystem der Form C*x = d und verwende den lsqlin Solver. Das funktioniert soweit einwandfrei.
Jedoch habe ich das Problem, dass mein experimenteller Datensatz (d) einen konstanten Offset aufweist.
Bisher löse ich das Problem so, dass ich einen bestimmten Bereich für den Baseline Offset definiere, dann d mit Hilfe des Ausdrucks d' = d + offset korrigiere und das in einem Loop löse. Der korrekte Offset ist dann über den Fit mit dem kleinsten RMSD-Wert gegeben. Das funktioniert soweit akzeptabel ist aber natürlich ungeheuer ineffizient.
Ich dachte mir nun, dass man den Offset doch eigentlich auch als "Floating Parameter" mit ins Gleichungssystem aufnehmen können sollte?! Allerdings habe ich keine Idee, wie man das mathematisch formulieren würde.
Hätte da jemand vielleicht einen Tipp für mich?
Vielen Dank und Grüße
Johannes
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| Harald |
Forum-Meister
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Verfasst am: 14.04.2016, 19:31
Titel:
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Hallo,
du könntest das als Optimierungsproblem für d auffassen (z.B. mit
fminbnd
) und als Zielfunktion das Least Squares-Problem lösen und die minimale Abweichung zurückgeben.
Das sollte effizienter sein als Optimieren durch Durchprobieren.
Grüße,
Harald
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