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[Bioinformatik]: BLAST mit Matlab |
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Verfasst am: 20.04.2010, 18:27
Titel: [Bioinformatik]: BLAST mit Matlab
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Hallo,
ich moechte eine Subject Sequenz und eine Query Sequenz miteinader vergleichen, genau wie auf der NCBI-Homepage: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.....&QUERY=&SUBJECTS=
Dabei interessieren mich die unter 'Alignments' ausgegebenen Parameter und Werte.
Jedoch weiss ich nicht wie das in Matlab funktioniert. Ich habe zwar den Befehl
gefunden, jedoch lasst sich damit nur eine Sequanz mit den Datenbanken vergleichen. Ich moechte aber einfach 2 manuell eingegenen Sequenzen miteinander vergleichen, jedoch mit der selben Methode wie bei NCBI und den selben Ausgaben als Ergebniss.
Jemand vielleicht ne Idee?
Schonmal vielen Dank fuer die Hilfe
MFG
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