Datenvektor mit NaN auffuellen

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HenningL

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Verfasst am: 20.01.2016, 14:15 Titel: Datenvektor mit NaN auffuellen

Hallo zusammen,
ich bin noch relativ unerfahren mit MATLAB und habe eine Frage zu folgendem Problem:
Ich habe einen Datenvektor sowie einen zugehoerigen Zeitvektor, allerdings gibt es innerhalb des Datensatzes Luecken, also z.B.:

time=[1,2,3,5,7];
data=[1,2,3,4,5];
Jetzt moechte ich den Datenvektor mit NaN so auffuellen, dass er zu einem vollstaendigen Zeitvektor passt, also:

time=[1,2,3,4,5,6,7];
data=[1,2,3,NaN,4,NaN,5];

Das habe ich wie folgt geloest:

Code:

data=[];
for i=[1:length(time)];
if any(timehmv_finish==time(i));
data(i)= data_complete(find(timehmv_finish==time(i)));
else data(i)=NaN;
end
end

Funktion ohne Link?

wobei "data_complete" der Ausgangsdatenvektor, "timehmv_finish" der Ausgangszeitvektor, "time" der durchgaengige Zeitvektor und "data" der aufgefuellte Datenvektor ist. (Entschuldigt die kryptische Namensgebung...)

In dieser Variante dauert das allerdings ewig, weil der Datenvektor ~800000 Werte enthaelt.
Ich denke mal es wird da eine geeignetere Methode geben die das ganze beschleunigt, oder ?

Ich habe schon einige Themen mit aehnlichen Problemen gefunden, jedoch moegen die Loesungen dort einfach nicht so ganz zu meinem Problem passen...

Vielen Dank schon mal fuer eure Vorschlaege !

Jan S

Moderator


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Verfasst am: 20.01.2016, 16:03 Titel: Re: Datenvektor mit NaN auffuellen

Hallo HenningL,

Das iterative Vergrößern eines Arrays benötigt extrem viele Resourcen. Wenn Du einen Vektor schrittweise von 1 bis 800000 Elemente anwachsen lässt, werden insgesamt sum(1:800000) * 8 Byte Speicher von Betriebssystem angefordert und kopiert: In der ersten Iteration 8 Byte für ein Double, in der zweiten Iteration 16 Byte für 2 Doubles und das erste wird kopiert, usw.
Das sind 2.56 TerraByte! Natürlich braucht das Zeit.

Die Lösung ist eine "Pre-allocation" (Du kannst danach im Forum suchen): Alloziere die entgültige Größe am Anfang und füge dann nur noch die Werte ein. In Deinem Fall ist eine Vorbelegung mit NaNs sinnvoll:

Code:

time = [1,2,3,5,7];
data = [1,2,3,4,5];
n = time(end);
newData = nan(1, n);
newData(time) = data;

Funktion ohne Link?

Da "time" die Natur eines Index-Vektors hat, kann man ihn direkt als Index-Vektor verwenden und den gesamten Code "vektorisieren".

Gruß, Jan

HenningL

Gast


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Verfasst am: 27.01.2016, 10:57 Titel:

Das hat super geklappt, dankeschoen Smile


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