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Effizient/Beschleunigt in Matrix schreiben?

 

der Vladi

Gast


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     Beitrag Verfasst am: 25.11.2010, 10:13     Titel: Effizient/Beschleunigt in Matrix schreiben?
  Antworten mit Zitat      
Hallo Gemeinde,

hab mal wieder eine Frage die die Geschwindigkeit meines Programmes betrifft.
Vereinfachend hab ich folgendes Problem
Code:

B = rand(100000, 500);
A = zeros(100000, 500);
for i = 1 : 500
    % take 80.000 values from B and copy them into A
    A(10000 : 90000, i) = B(10000 : 90000, i);
end
 


Der Profiler zeigt nun an, dass sich die Laufzeit zu etwa 40:60 aufteilt.
40% fürs Kopieren in der Schleife, und 60% für die Erzeugung von B.

Frage: Warum dauert das einfache Schreiben in eine Matrix so lange?
Kann man das beschleunigen?

Um korrekt zu sein:
In meinem Programm werden, wie im Beispiel, Einträge einer Matrix B spaltenweise in eine Matrix A kopiert. Jedoch immer in unterschiedlicher Länge.
Es geht aso tatsächlich nur um das Schreiben in eine Matrix.

Bin auf (positive) Antworten gespannt!

Danke schonmal allen, die den Beitrag lesen.

Viele Grüße
der Vladi


Achi
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     Beitrag Verfasst am: 25.11.2010, 10:31     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Vektorisieren hilft hier prima, was auch ganz einfach in dem Beispiel ist.


Code:


B = rand(100000, 500);
A = zeros(100000, 500);
 i = 1 : 500;
    % take 80.000 values from B and copy them into A
    A(10000 : 90000, i) = B(10000 : 90000, i);

 
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Thomas84
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     Beitrag Verfasst am: 25.11.2010, 10:56     Titel:
  Antworten mit Zitat      
es sollen aber immer unterschiedliche Einträge kopiert werden also kann man hier nicht so einfach vektorisieren. Ich glaub kaum das es eine schnellere Lösung gibt.

viele Grüße
Thomas
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der Vladi

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     Beitrag Verfasst am: 25.11.2010, 11:07     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Hallo Thomas, Hallo Achi

Danke für die schnellen Antworten!
Wie Thomes sage, sollen unterschiedliche Einträge kopiert werden.
Genauer gesagt, wenn die Schleife startet werden noch zahlreiche Dinge berechnet, die genauer spezifizieren, welche Zeilen der Spalte i aus B gewählt werden und in A eingetragen werden.

An der Schleife kann ich also nicht rütteln.

Danke!

Viele Grüße
der Vladi
 
Achi
Forum-Guru

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     Beitrag Verfasst am: 25.11.2010, 11:16     Titel:
  Antworten mit Zitat      
i ist immer ein 1er Inkrement? Und du hast die Paralle Computing Toolbox?

Dann hilft:
Code:
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der Vladi

Gast


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     Beitrag Verfasst am: 25.11.2010, 11:33     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Hallo Achi,

leider hab ich die Parallel Computing Toolbox nicht.

i ist ein 2er Inkrement.
Allerdings wird aufgrund des Wertes von i von einem weiteren Array zwei Werte 'up' und 'down' ausgelesen. Diese Werte werden dann nochmal verändert, abhängig davon wie der Wert von i ist.
Danach erst kopiere ich in Spalte i die Zeilen von 'up' bis 'down'.

Die Schleife ist schon vektorisiert (also der größte Teil der in ihr steht) und die äußere kann ich leider nicht umgehen.

Danke und viele Grüße
der Vladi
 
Jan S
Moderator

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     Beitrag Verfasst am: 26.11.2010, 03:02     Titel: Re: Effizient/Beschleunigt in Matrix schreiben?
  Antworten mit Zitat      
Hallo Vladi,

Du könntest den ganzen relevanten Teil des Programms posten. Mit vereinfachten Ausschnitten ist die Vektorisierung sehr einfach. Was man aus dem orginalen Programm noch verbessern kann, ist aber nur ersichtlich, wenn das orginale Programm bekannt ist.

Gruß, Jan
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