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eindimensionaler Molekulardynamik Code

 

sutdent
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Beiträge: 12
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Version: ---
     Beitrag Verfasst am: 06.06.2018, 18:34     Titel: eindimensionaler Molekulardynamik Code
  Antworten mit Zitat      
Hallo gomatlab Forum,
ich versuche gerade einen eindimensionalen Molekulardynamik Code zu schreiben in dem 2 Sauerstoffatome in einem Abstand von 4A positioniert sind und das den Abstand der Atome, wie auch die absolute Postion bzgl. des Schwerpunktssystems als Funktion der Zeit grafisch darstellt. Die Anfangsgeschwindigkeiten habe ich entsprechend der Temperaturen 0K, 50K und 100K gewählt. Nun weiß ich allerdings noch nicht so recht wie ich das ganze angehen soll. Confused

Mein Code bis jetzt:

Code:
N=2; % Anzahl der Atome
L=10; %kantenlänge der Box in Angstrom
sig=4; % Abstand der Atome
T1=0;  % Temperatur in K
T2=50;
T3=100;
tf=20; % Zielzeit der Integration [ps]
tau=0.01; % Schrittweite

v_rms_1 = 0; %für T=0K
v_rms_2 = 181.9; %für T=50K
v_rms_3 = 257.25; %für T=100K

[x]=meshgrid(sig*(1));
x=x(:);
 

Hat vllt jmd. einen Tipp für mich?
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