Fread und fprintf Operation beschleunigen

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Mo3bius

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Verfasst am: 26.02.2013, 17:34 Titel: Fread und fprintf Operation beschleunigen

Hi,
ich habe den zeitaufwendigsten Teil meines Codes mit Zeitangaben herauskopiert:

Code:

while(~feof(fid_in)),
44.14 2920779 57 tmp = fread(fid_in,6,'uint16');
58
19.75 2920779 59 if(isempty(tmp)),
9 60 break;
61 end
62
143.19 2920770 63 fprintf(fid_out,str,[counter;tmp]);
64
15.35 2920770 65 counter = counter + 1;
31.22 2920770 66 end

Funktion ohne Link?

Zur Erklärung:

Ich lese eine Binärdatei Zeilenweise ein, überprüfe ob was darin steht und schreibe die Dezimalzahl dann in eine neue Datei. Was würdet ihr anders machen, bzw. wie könnte ich das beschleunigen?

Grüsse,
Mo3bius

Jan S

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Verfasst am: 26.02.2013, 18:16 Titel: Re: Fread und fprintf Operation beschleunigen

Hallo Mo3bius,

Was ist "str"?

Vielleicht dies:

Code:

while 1 % You use BREAK already to stop the loop
tmp = fread(fid_in, 6, 'uint16=>uint16'); % No conversion to double
if isempty(tmp)
break;
end
fprintf(fid_out, '%d: ', counter);
fprintf(fid_out, '%d %d %d %d %d %d', tmp);
counter = counter + 1;
end

Funktion ohne Link?

Soll die neue Datei ein Text-File sein?

Oder versuche mal dies:

Code:

data = fread(fid_in, [6, Inf], 'uint16');
data = [1:size(data, 2); data];
fprintf(fid_out, str, data);

Funktion ohne Link?

Dann muss der Schreib-Lese-Kopf nich zwischen den Datein hin- und herspringen.

Gruß, Jan

Mo3bius

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Verfasst am: 26.02.2013, 19:40 Titel:

Hallo Jan,

also "str" ist ein Formatierungsstring, der genau was Gleiche tut, wie dein Code.

Vielen Dank für diesen guten Code, ich habe jetzt das Zweite Beispiel genommen. Mir war nicht bewusst, dass man mit fread in ein Array lesen kann.

Der Code braucht jetzt statt 236 Sekunden gerade noch 14.7 Sekunden!!!!

Grüsse,
Mo3bius

Jan S

Moderator


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Verfasst am: 27.02.2013, 16:00 Titel:

Hallo Mo3bius,

Prima, das ist ja schonmal eine nette Beschleunigung.

Wenn Du noch den Inhalt von "str" postest, würde mir vielleicht noch ein Verbesserungsvorschlag einfallen. Das es ein Format-String ist, habe ich mir schon gedacht, aber welcher?! Es kann einen deutlichen Unterschied machen, ob man die Daten als DOUBLEs (mit 8 Byte pro Element) oder ohne Konvertierung als UINT16 (2 Bytes per Element) abspeichert. Die Konvertierung von UINT16 nach DOUBLE ist zwar nicht sehr aufwändig, aber trotzdem möglicherweise unnötig.

Gruß, Jan


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