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Hierarchical Clustering und P-values |
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| beginner2 |
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Verfasst am: 16.08.2010, 19:11
Titel: Hierarchical Clustering und P-values
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Hi,
gibt es in Matlab eine Möglichkeit hierarchisches clustering mit diversen methoden (average-linkage, ward, etc.) und distance measures (euclidian, manhattan, canberra, etc.) durchzuführen und für das daraus resultierende Dendrogram P-values zu berechnen? Ich bräuchte für jeden Knoten/Division/Cluster einen separaten p-value der mir sagt ob ein cluster durch Zufall entstanden ist oder nicht.
Bin leider absoluter Neuling in Matlab und müsste die Auswertung meiner Daten aber relativ zügig hinbekommen. Ich hab schon viel programmiert, so dass ich denke, dass ich mit der Syntax in Matlab etc. nicht all zu große Probleme haben werde.
Vielen Dank für euere Anregungen.
Gruß
beginner
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| Harald |
Forum-Meister
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Verfasst am: 16.08.2010, 19:30
Titel:
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Hallo,
die benötigte Toolbox ist die Statistics Toolbox. Relevante Befehle sind:
Grüße,
Harald
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| beginner2 |
Themenstarter
Forum-Newbie
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Beiträge: 2
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Verfasst am: 16.08.2010, 21:06
Titel:
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Hi Harald,
danke für deine Antwort. Ich hatte gerade noch einmal kurz Zeit und hab mich mal kurz durch die Matlab Hilfe geklickt. Was mir aufgefallen ist ist, dass man mittels der Befehle die du aufgezeigt hast, hierarchisches clustering durchführen kann aber die eigentlich für mich wichtigen p-values lassen sich damit anscheinend nicht berechnen.
LG
Hans
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| Harald |
Forum-Meister
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Verfasst am: 16.08.2010, 23:00
Titel:
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Hallo,
das sind die mir bekannten Befehle in MATLAB, die direkt damit zu tun haben.
Wenn man da nicht fündig wird, würde ich als nächsten Schritt File Exchange vorschlagen:
http://www.mathworks.com/matlabcent.....term=hierarchical+cluster
Ansonsten bleibt wohl nur, weiter zu suchen oder aufbauend auf dem gefundenen das ganze selbst zu implementieren.
Grüße,
Harald
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