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Matlab R cox Modell

 

y_fotsing
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Beiträge: 45
Anmeldedatum: 26.03.09
Wohnort: ---
Version: ---
     Beitrag Verfasst am: 16.07.2009, 13:14     Titel: Matlab R cox Modell
  Antworten mit Zitat      
Hallo Zusammen,
ich möchte gern über Matlab einige Befehle von R benutzen. Dafür habe ich mir den Toolbox Matlab_RLink installiert.

Wenn ich aber das untere Programm ausführe, bekomme ich folgende Fehlermeldung:

??? Error using ==> evalR at 58
Problem evaluating command coxph(Surv(time, status) ~ x + strata(sex),
test1).
Invoke Error, Dispatch Exception: Das Objekt ist statisch. Der Vorgang
ist nicht erlaubt.


Programm:

openR
% Create the simplest test data set
evalR('time=c(4,3,1,1,2,2,3)')
time=getRdata('time')
evalR('status=c(1,1,1,0,1,1,0)')
status=getRdata('status')
evalR('x=c(0,2,1,1,1,0,0)')
x=getRdata('x')
evalR('sex=c(0,0,0,0,1,1,1)')
sex=getRdata('sex')
evalR('test1 <- list(time, status, x, sex)')
test1=getRdata('test1')
% Fit a stratified model
evalR('coxph(Surv(time, status) ~ x + strata(sex), test1)')

%% Close the connection
closeR

Weiß jemand, wo ich einen Fehler mache?
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Andreas Goser
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Beiträge: 3.654
Anmeldedatum: 04.12.08
Wohnort: Ismaning
Version: 1.0
     Beitrag Verfasst am: 16.07.2009, 17:25     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Google spuckt 3 Hits für "Matlab_RLink" aus, aber das sieht nicht passend aus. Was ist den das für eine Toolbox?

Andreas
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Andreas Goser
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Beiträge: 3.654
Anmeldedatum: 04.12.08
Wohnort: Ismaning
Version: 1.0
     Beitrag Verfasst am: 16.07.2009, 17:29     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Habe es:

http://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/5051

Ist von einem MathWorks Mitarbeiter, aber FileExchange Postings sind gewissermassen Privatsache (so wie meine Beiträge hier Smile ). Ich schaue mal was sich machen lässt.

Andreas
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derOli
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Beiträge: 579
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Wohnort: Leipzig
Version: 2010a
     Beitrag Verfasst am: 16.07.2009, 17:44     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Hi, wusste nicht, dass es sowas gibt. Aber warum nicht das hier nehmen?:

http://www.mathworks.com/access/hel.....olbox/stats/coxphfit.html

Grüße,

der Oli
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Andreas Goser
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Beiträge: 3.654
Anmeldedatum: 04.12.08
Wohnort: Ismaning
Version: 1.0
     Beitrag Verfasst am: 16.07.2009, 17:56     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Es könnte sogar mathematisch das gleiche sein. Aber R Nutzer die in Richtung MATLAB umsteigen (oder Code von Kollegen nutzen) möchten das natürlich nicht alles umstellen.

Da die Fehlermeldung gemischtsprachig ist muss die ich die Übersetzung raten. Das hat aber keine Hinweise gebrachr. Können wir die Fehlermeldung komplett in englischer Sprache bekommne, also wenn man Windows kurzfristig auf Englisch (US) umstellt?

Andreas
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