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MRT-Bild Analyse

 

hadab
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Beiträge: 1
Anmeldedatum: 12.01.15
Wohnort: ---
Version: ---
     Beitrag Verfasst am: 13.01.2015, 13:21     Titel: MRT-Bild Analyse
  Antworten mit Zitat      
hallo zusammen, ich bin neu bei Matlab. ich möchte MRT Bilder analysier. es geht um Aufnahme von 6 verschiedenen Gele. ich möchte die t1 und t2 des jeweiligen Gelmaterials bestimmen. ich benötige ein Matlab Befhl mit dem ich aus allen 6 Objekte (in einem Schicht) die Bereiche auswähle, wo kleine Scwankungen auftreten und die Grauwerte dazu in einen array packen. Danke das Bild ist im Anhang

Gel.fig
 Beschreibung:

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 Dateiname:  Gel.fig
 Dateigröße:  16.07 KB
 Heruntergeladen:  535 mal
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cvanommer
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Beiträge: 32
Anmeldedatum: 02.03.15
Wohnort: Garching bei München
Version: R2015a
     Beitrag Verfasst am: 09.03.2015, 11:47     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Hallo Hadab,

Abgeleitet von einem Matlab Beispiel (mathworks.com/help/images/examples/correcting-nonuniform-illumination) finden Sie hierunter ein Code die Ihnen weiten helfen könnte bei der Analyse.

cvanommer hat Folgendes geschrieben:
Code:

close all; clear all; clc;
RGB = imread('gel.png');
I = rgb2gray(RGB); imshow(I)

%{
% noise removal
K = filter2(fspecial('average',1),I)/255;
figure (2), imshow(K);
%}

% use black-white for computing
figure(3)
level = graythresh(I);bw = im2bw(I,level);bw = bwareaopen(bw, 50);
imshow(bw)

% Identify Objects in the Image
numberofobjects = bwconncomp(bw, 4)
area_and_position = regionprops(cc,'basic')


cvanommer hat Folgendes geschrieben:
Dadurch dass das Bild verschwummen ist, werden mehrere Zellen in dem scharz-weiss Bild überlagert. Sie könnten ein passenden Filter aussuchen die dieses verhinder kann.

Eine nicht so korrekte wissenschaftliche Lösung wäre es um mit Paint eine schwarze Linie zwischen die Zellen zu zeichen, um damit Matlab zu helfen mit weitere Analyse.

Viel Erfolg!
Christiaan
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