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Parfor-loop - Classification Issues

 

ottto
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     Beitrag Verfasst am: 12.12.2019, 18:39     Titel: Parfor-loop - Classification Issues
  Antworten mit Zitat      
Hi zusammen,

ich versuche gerade meinen Code mit einer parfor-Schleife zu beschleunigen. Leider wird mir dabei bisher ein Fehler ausgespuckt: "Unable to classify the variable 'merkmalTabelle' in the body of the parfor-loop.".
Über Hilfe wäre ich sehr dankbar. Danke im Voraus!

Code:

Signale = [1 2 3 4]

parfor a = Signale

        indexSignal = a;
       
        signal = Segmentdaten{:,indexSignal};
        signal(isnan(signal))=0;

        %Merkmale extrahieren in Segment für Signal
        [merkmalvektor,~] = featureExtractionSingleSignal(signal, AbtastfrequenzR);        
        %Abspeichern in Tabelle
        merkmalTabelle(zaehlvariableSegment,((indexSignal-1)*AnzahlMerkmaleSE+1):((indexSignal)*(AnzahlMerkmaleSE))) =  array2table(merkmalvektor);


    end
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Harald
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     Beitrag Verfasst am: 12.12.2019, 20:20     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Hallo,

die Indizierung ist äußerst aufwändig. Was ist denn zaehlvariableSegment?

Das einfachste dürfte sein, die Ergebnisse in einem Cell Array zwischenzuspeichern und nachträglich zusammenzufügen, zur Not in einer weiteren for-Schleife.

Grüße,
Harald
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ottto
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     Beitrag Verfasst am: 13.12.2019, 15:39     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Hallo Harald,

vielen Dank für deine Antwort. Ich habe den Code nun vereinfacht. Könntest du mir anhand eines Beispiels zeigen, wie ich die Ergebnisse so in einem Cell-Array zwischenspeichern kann, damit es funktioniert?

Code:
   
Signale = [1:3];
startIndices = [1 41 81];
endIndices = [40 80 120];  
   
    parfor i = Signale
       
        indexSingnal = i;

        signal = Segmentdaten{:,indexSignal};


        %Merkmale extrahieren für Signal
        [merkmalvektor,~] = featureExtractionSingleSignal(signal, AbtastfrequenzR);        
        %Abspeichern in Tabelle
        merkmalTabelle(startIndices(i):endIndices(i)) =  array2table(merkmalvektor);
        %Header hinzufügen
        [~,merkmalBeschreibung] = featureExtractionSingleSignal(signal, AbtastfrequenzR);
        signalName = signalNamen{indexSignal};
        merkmalTabelle.Properties.VariableNames(Startindices(i):endIndices(i)) = strcat(merkmalBeschreibung,' Signal:', signalName);

    end
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Harald
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     Beitrag Verfasst am: 13.12.2019, 15:46     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Hallo,

etwa so:

Code:
Signale = [1:3];
startIndices = [1 41 81];
endIndices = [40 80 120];  
   
    parfor i = Signale
       
        indexSignal = i;

        signal = Segmentdaten{:,indexSignal};


        %Merkmale extrahieren für Signal
        [merkmalvektor{i},merkmalBeschreibung{i}] = featureExtractionSingleSignal(signal, AbtastfrequenzR);        
       
    end
for i = Signale
%Abspeichern in Tabelle
        %Header hinzufügen
        signalName = signalNamen{i};
        merkmalTabelle(startIndices(i):endIndices(i)) =  array2table(merkmalvektor{i});
        merkmalTabelle.Properties.VariableNames(Startindices(i):endIndices(i)) = strcat(merkmalBeschreibung{i},' Signal:', signalName);
end


Grüße,
Harald
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ottto
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     Beitrag Verfasst am: 13.12.2019, 15:52     Titel:
  Antworten mit Zitat      
Super, danke für die schnelle Antwort.
Ich hatte Bedenken, dass die dynamische Erweiterung des Zwischenspeichers (hier jetzt: merkmalvektor und merkmalBeschreibung) laufzeittechnisch nicht ideal ist. Aber wahrscheinlich ist das vernachlässigbar, da die meiste Zeit sowieso die Funktion "featureExtractionSingleSignal" in Anspruch nimmt.

Grüße,
Lorenz
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