Scatter plot auf richtige Skala bringen

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RatioTM

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Verfasst am: 31.05.2018, 22:10 Titel: Scatter plot auf richtige Skala bringen

Hallo,

ich moechte verschiedene Daten im Scatter plot nach ihrer Intensität plotten (im Anhang sind zwei Beispiele zu sehen). Anhand des Anhangs könnt ihr auch mein Problem erkennen:
Ich möchte meine Daten so skalieren dass
i) die Punkte in figure2 gut erkennbar sind (was zur Zeit okay ist)
ii) die Punkte in figure1 nicht meine Achsenbeschriftung verlassen und viel zu groß erscheinen.

Ich habe versucht, alles auf eine log skala zu setzen, jedoch bringt das keine Lösung..gibt es eine Möglichkeit, bei scatter anzugeben, in welchen Schritten er die Punkte vergrößern soll?

Vielen Dank!

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Harald

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Verfasst am: 31.05.2018, 22:38 Titel:

Hallo,

du kannst als drittes Argument einen Vektor von Größen angeben. Wenn du das logarithmisch skaliert haben willst, dann musst du da halt log(data) übergeben - ggf. gerundet.

Grüße,
Harakd

RatioTM

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Verfasst am: 31.05.2018, 22:49 Titel:

Hi Harald,

danke für den Tip!
Ich verwende derzeit bereits drei Argumente:

Code:

figure ('Color', 'white')
s1=scatter(Exactmass, massdefect, intensity_1945_05(1:2,:),'fill','MarkerEdgeColor','k','Linewidth',1);
s1.MarkerFaceColor= [0 0.2 0.3];

Funktion ohne Link?

Wobei intensity mein Argument ist, welches die Größe meiner Punkte definiert. Ich weiß auch bisher nicht, ob die log skala die Lösung meines Problems darstellt..
meine range im intensity Vektor sieht wie folgt aus (10x1 Matrix):

0.0464664532086389
0.000535975225479992
3.08830022249943e-07
3.03230780334605e-05
2.93912034469959e-06
3.53273973964831e-05
0.00483591374374730
0.000216191942141214
0.000246657850081975
0.000216972297670900

Ich nehme an, die große Range (über 7 Größenordnungen) ist die Ursache meines Problems...

Harald

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Verfasst am: 31.05.2018, 22:52 Titel:

Hallo,

Zitat:

Ich weiß auch bisher nicht, ob die log skala die Lösung meines Problems darstellt..

Was passiert denn, wenn du's versuchst? ;)

Mich verwundert an dem Code vor allem, dass du zwei Zeilen aus intensity_1945_05 extrahierst. Ist das wirklich so sinnvoll?

Grüße,
Harald

RatioTM

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Verfasst am: 31.05.2018, 23:07 Titel:

Harald hat Folgendes geschrieben:

Hallo,

Zitat:

Ich weiß auch bisher nicht, ob die log skala die Lösung meines Problems darstellt..

Was passiert denn, wenn du's versuchst? Wink

Mich verwundert an dem Code vor allem, dass du zwei Zeilen aus intensity_1945_05 extrahierst. Ist das wirklich so sinnvoll?

Grüße,
Harald

Mein Code sieht eigentlich so aus:

Code:

figure ('Color', 'white')
s1=scatter(Exactmass(5:6,:),massdefect(5:6,:),intensity_1945_05(1:2,:), 'fill','MarkerEdgeColor','k','Linewidth',1);
s1.MarkerFaceColor= [0 0.2 0.3];

Funktion ohne Link?

Das Ganze geht noch weiter über mehrere hold on Befehle..ich habe nur einen Ausschnitt genommen Smile

Ich habe jetzt folgendes probiert:

Code:

figure ('Color', 'white')
s1=scatter(Exactmass(5:6,:),massdefect(5:6,:),intensity_1945_05(1:2,:),[0.0464664532086389 0.000535975225479992 ],'fill','MarkerEdgeColor','k','Linewidth',1);
s1.MarkerFaceColor= [0 0.2 0.3];

Funktion ohne Link?

selbiges habe ich mit log (intensity_1945_05(1:2, Smile

), wobei ich noch keinen Unterschied erkennen kann..ich denke ich muss irgendwas an meinen Daten ändern und diese auf eine skala bringen, bei der die Proportionen auf der einen Seite noch stimmen, auf der anderen Seite aber nicht mehr über 7 Größenordnungen variiert wird...

RatioTM

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Verfasst am: 31.05.2018, 23:17 Titel:

achja: mit folgendem habe ich auch bereits gearbeitet:

Code:

figure ('Color', 'white')
s1=scatter(Exactmass(5:6,:),massdefect(5:6,:),log(intensity_1945_05(1:2,:)),'fill','MarkerEdgeColor','k','Linewidth',1);
s1.MarkerFaceColor= [0 0.2 0.3];

Funktion ohne Link?

Das macht mir die ganze Sache nur leider deutlich zu klein und die Unterschiede nicht wirklich sichtbar...

Harald

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Verfasst am: 31.05.2018, 23:42 Titel:

Hallo,

dann nimm einen Vorfaktor? Oder addier was dazu?
Die Logarithmen sind ja bei Zahlen < 1 negativ. Das ist für Punktgrößen nicht so recht sinnvoll.

Grüße,
Harald


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